救生艇的引擎在剧烈震颤，工藤新一死死攥着琴酒抛出的怀表，表盘内侧的微型摄像头还在持续运转。

直升机的轰鸣声越来越近，探照灯的光束如利剑般刺破海面，却在距离救生艇百米外突然转向，像是被某种力量牵引着偏离了轨道。

“不对劲！”工藤新一将怀表塞进内袋，指尖触到冰冷的金属时，突然想起琴酒临别前那抹意味深长的眼神。

他转头望向战场方向，琴酒与茱蒂的枪／声已经渐渐稀疏，取而代之的是某种低沉的嗡鸣，仿佛远古巨兽在深海苏醒。

海底深处，一艘漆黑的潜艇缓缓浮出水面。工藤新一瞳孔骤缩，艇身上若隐若现的乌鸦纹章与琴酒怀表上的图案如出一辙。

舱门开启的瞬间，赤井务武的身影出现在阴影中，老荷官的金丝眼镜泛着冷光：“上船，来不及解释了。”

救生艇刚靠近潜艇，工藤新一便被一股强大的吸力拽入舱内。

舱门重重关闭的刹那，工藤新一看到海面泛起诡异的涟漪，数十条银色机械触手从海底探出，将救生艇绞成碎片。

琴酒的戒指在口袋里发烫，后颈的时空粒子疯狂跳动，仿佛在警示着某种危机。

“这是组织的秘密潜艇？”工藤新一扶着震颤的舱壁，目光扫过布满仪表盘的控制室。

赤井务武正在操作台前忙碌，屏幕上跳动的数据流中，赫然夹杂着琴酒的基因图谱和乌丸莲耶的全息头像。

老荷官头也不回地开口：“准确来说，是二十年前‘潘多拉’号的残骸改造体。”

记忆如潮水般涌来。

工藤新一想起记忆芯片中的画面：二十年前，赤井务武与琴酒的父亲在实验室里激烈争执，桌上摊开的图纸正是这艘潜艇的设计图。

“你们早就知道乌丸莲耶的计划？”少年侦探的声音带着难以置信。

赤井务武终于转身，镜片后的目光深邃如渊：“二十年前，我和琴酒的父亲试图阻止时空实验，却被组织追杀。‘潘多拉’号表面是科考船，实则是初代时空穿越装置的载体。”

赤井务武调出一张老照片，照片里年轻的琴酒站在船头，身旁的男人与他有着七分相似，“琴酒的父亲为了保护儿子，将他的基因样本和时空粒子数据藏在了这艘潜艇里。”

工藤新一的太阳穴突突跳动，记忆芯片与后颈纹路产生共鸣。

他看到更多画面：琴酒八岁那年，父亲在实验室被杀害，临死前将一枚刻有鸢尾花的戒指塞进他手中；赤井务武暗中收集证据，却在即将成功时遭遇埋伏，从此销声匿迹。

“所以琴酒才会被选为实验体。”工藤新一喃喃道，“因为他的基因里藏着打开时空装置的密钥。”他握紧口袋里的戒指，内侧的鸢尾花纹路与潜艇控制台的启动键完美契合。

赤井务武点头，启动了某个隐藏按钮。潜艇底部传来齿轮转动的声响，墙壁缓缓升起，露出一个巨大的透明舱室。

工藤新一倒抽一口冷气——舱室内，无数装着蓝色液／体的培养皿整齐排列，每个培养皿上都标注着不同的时间坐标，而中央的主屏幕上，赫然显示着乌丸莲耶的全息投影。

“这是组织的时空档案馆。”赤井务武的声音低沉而沙哑，“乌丸莲耶通过克隆技术和记忆移植，试图将自己的意识注入不同时空的载体。而你和琴酒，正是他选中的完美容器。”

赤井务武调出一段监控录像，画面里，幼年的工藤新一在游乐园玩耍，暗处有无数双眼睛在注视。